一、 基督教学者认为人有三魂，即灵体，魂体，肉体。人跟动物是不同的，基督教认为人有理性，会思考，知道礼义廉耻，“明人之不可与禽兽同也”。而佛教学者的观点是“狗子有佛性”，动物也具有佛性，因此“一切众生，皆系平等”，人有轮回，今世为人，下世就有可能轮回为动物。

二、 明末佛教学者与基督教学者分别就三魂说提出了自己的观点。佛教认为三魂说会导致人不善意对待动物，随便的猎杀；看这个世界，有的人只是“念饮食淫欲，他无所知，与禽兽何异？”佛教认为有的人活着还不如禽兽。

三、 基督教学者针对灵魂存在与不灭提出四点。

理论之一是动物的灵魂是由水土气火组成的，身体死亡灵魂也就灭亡了。人的肉体虽然也是由水土气火组成，但是人里面的灵魂是由上帝赐予的，这个是不能灭亡的。

上帝是公正的审判者，“善者必赏，恶者必罚”，现世有恶人得享富贵，善人却遭贫困，但是上帝会在人死后对其灵魂进行审判，如果灵魂灭亡，上帝还怎么惩罚呢？此乃第二理论。

利玛窦提出了：人的灵魂深处是渴望永生的，所以有那么多人去深山修行，这样的人不看重今世，而是“祈望来世真福”，如果灵魂是死后就灭亡了，那岂不是枉费了这些？这是第三点理论。

最后一点理论是人类对死后生活有永恒的探究，动物对这些不会关心，它们也不会思考自己死后的日子如何。

四、 从人的逻辑思维、爱欲推证灵魂的“常生常在”，从儒家典籍《大学》中寻找灵魂不灭的证据。

最后郑安德教授就“灵魂”与“心性”做了简单的解释说明。万物都是出于创造之主，人是“万物之灵”，天主看不见，却是一切的主宰者。灵魂从神而来，佛教不知灵魂从何而来，而讲究“悟者贵在其悟”。